В своем режиссерском дебюте американский драматург Джон Патрик Шэнли, переносит на экран собственную пьесу "Сомнение" — произведение, которое принесло ему ряд престижных наград, включая Пулитцеровскую премию. Действие пьесы происходит в шестидесятые годы в нью-йоркской католической школе Святого Николая, где сталкиваются характеры двух людей в сутанах — консервативной Сестры Алоизии и Отца Флинна, придерживающегося прогрессивных взглядов на роль церкви в меняющемся мире. Их конфликт становится неразрешимым, когда Сестра Алоизия обвиняет своего оппонента в "аморальных отношениях" с одним из учеников.